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1929年11月，他与[[谢·米·基洛夫]]发生冲突，并试图联手列宁格勒省党委的其他干部扳倒他。次月11日，[[联共（布）中央政治局]]和[[联共（布）中央监察委员会|中央监察委员会主席团]]认为科马罗夫对基洛夫的指控是诽谤性的。次月1月7日，联共（布）中央政治局解除了科马罗夫在列宁格勒省的职务，将他调离到其他地方。认为科马罗夫对基洛夫的指控是诽谤性的。

1930年1月，任1930年1月7日，联共（布）中央政治局解除了科马罗夫在列宁格勒省的职务，将其调任[[苏联最高国民经济会议]]主席团委员、建筑联盟主席。