1989年3月,乔石同志兼任中共中央党校校长。他大力推进深化党校改革,强调理论学习和教育是加强党的领导和建设的一项根本举措,要适应国际国内的新形势加强干部理论教育,坚持用马克思主义理论特别是[[邓小平]]同志建设有中国特色社会主义理论武装教育干部,强调坚持理论联系实际的方针,把学习基本理论、坚持基本路线同加强党性教育、增强党性锻炼结合起来,同研究、探索、回答现实问题结合起来,善于运用马克思主义的立场观点方法解决中国社会主义现代化建设中的实际问题,明确提出了新形势下“各级党校要努力办成轮训和培训党员领导干部,培养党的理论队伍,学习、研究、坚持和发展马克思列宁主义、毛泽东思想的重要阵地,成为干部增强党性锻炼的熔炉”的基本任务,并对党校的培养目标、教学方针、班次和课程设置等重要问题作出了规定,使党校工作进入了一个新的发展时期。<ref name="乔石同志生平" />
1989年6月中共十三届四中全会之后,在以[[江泽民]]同志为核心的党中央领导下,乔石同志为党和国家事业发展做了大量卓有成效的工作。1992年邓小平同志发表南方谈话后,乔石同志积极支持、宣传邓小平同志改革开放的思想主张,强调中共十一届三中全会以来的基本路线和方针政策完全正确,“没有改革开放,就没有中国的今天”,“只要我们坚持深化改革,扩大开放,坚定不移地沿着有中国特色的社会主义道路走下去,就一定能克服前进中的困难,使中国的经济在90年代跨上一个新台阶”,“社会主义只有经过改革开放,才能不断完善和发展,搞封闭是没有出路的”,旗帜鲜明表达了进一步解放思想、努力扩大改革开放的坚定立场。他高度重视对南方谈话精神的学习贯彻工作,强调要从“思想上的再一次大解放”的高度深入学习贯彻南方谈话精神,结合纪检、政法战线和党校的实际,解放思想,更新观念,努力为经济建设服务。同志为核心的党中央领导下,乔石同志为党和国家事业发展做了大量卓有成效的工作。1992年[[邓小平]]同志发表南方谈话后,乔石同志积极支持、宣传邓小平同志改革开放的思想主张,强调中共十一届三中全会以来的基本路线和方针政策完全正确,“没有改革开放,就没有中国的今天”,“只要我们坚持深化改革,扩大开放,坚定不移地沿着有中国特色的社会主义道路走下去,就一定能克服前进中的困难,使中国的经济在90年代跨上一个新台阶”,“社会主义只有经过改革开放,才能不断完善和发展,搞封闭是没有出路的”,旗帜鲜明表达了进一步解放思想、努力扩大改革开放的坚定立场。他高度重视对南方谈话精神的学习贯彻工作,强调要从“思想上的再一次大解放”的高度深入学习贯彻南方谈话精神,结合纪检、政法战线和党校的实际,解放思想,更新观念,努力为经济建设服务。<ref name="乔石同志生平" />
1992年10月,乔石同志在中共十四届一中全会上再次当选为中央政治局委员、常委。<ref name="乔石同志生平" />